溫度影響微生（shēng）物酶係的活力，這些酶（méi）分別（bié）決定微生物的（de）初級（jí）代謝生（shēng）產和次級代謝產抗。不同微生物菌種的生長溫度不（bú）一樣，而生長（zhǎng）和（hé）產抗節（jiē）點（diǎn）的最適溫度也有差異。發酵溫度的設計要綜合考慮能源消耗、發酵周期、穩定培養和產率水平因素。必要時需考（kǎo）慮變溫培養。生產中，溫度的控製通常采用冷卻水（shuǐ）通入發酵罐的蛇管（guǎn）或夾套中熱（rè）交換保持發酵溫度（dù）。

PH對微生物的影響，主要也（yě）是作用於酶，對營養利用和（hé）細胞結構也有重要（yào）影響。PH調節需生理酸（suān）堿性物質（zhì）的搭配、緩衝體係的設計等（děng）。另外（wài）可以加入外源性的酸堿物質進行調控，如鹽酸（suān）、氨水等。在流補體係中，往（wǎng）往通過葡萄糖和氨水的流加平衡PH，同時也兼具營養補充功能。

工業微（wēi）生物大都為好氧微生物，工業發酵中，將無菌空（kōng）氣通入（rù）培養基（jī），通過攪拌（bàn）槳分散氣體以實現有效利用，同時維持一（yī）定罐壓以增（zēng）大（dà）氧的溶解度。氧氣的利用情況可通過溶氧電極、發酵尾氣分析儀等控（kòng）製及監測。

生長和產抗往往有不同（tóng）的氧需求。通過調節通氣量、攪拌速率、罐壓可以有效控製和保證氧的供給。

發酵生產（chǎn）培（péi）養中，攪拌促進（jìn）氧的分散利用，但槳葉尖端（duān）末速形成的剪切力也會損傷菌體，造成菌（jun1）體斷裂破碎，進而導致二次生長、粘度提高、菌（jun1）種變異等情況，使發酵（jiào）惡（è）化。對剪切力控製可以通過（guò）篩選（xuǎn）菌種，調節設備攪拌選型等加以控製。

除此（cǐ）之外（wài），如：滅（miè）菌條件、發酵過（guò）程泡沫（mò）、種子質量、設備（bèi）選型、人員操作、環境因素等都是影響發酵過程的重要因素，因此在工（gōng）業發酵控製過程中，上述影響因素都必需納入其（qí）控（kòng）製係統（tǒng）及質（zhì）量監管中。